Пути назад нет, если спец. режим по факту признан или как нерасторопность налоговой сыграла в пользу УСН.
А начиналось все достаточно обычно:
Возник на первый взгляд обычный инцидент между налоговиками и организацией. Инспекция заблокировала счета организации на том основании, что та не сдала декларацию по НДС. Казалось бы, все, бесспорно. Но компания оспорила действия налоговой в суде, где сослалась на фактическое применение УСН, хотя и согласилась с тем фактом, что уведомление подано не было.
С момента создания и до возникновения спора, то есть около двух лет, организация платила единый налог и сдавала декларации по УСН. Причем, когда компания опоздала с уплатой и с подачей отчетности по спецрежиму, инспекция даже направляла ей соответствующие данному режиму требования и штрафовала.
Судебные тяжбы:
Первая инстанция и апелляция подошли к рассмотрению дела с формальной стороны: уведомления не было, значит, организация не могла применять УСН, она должна была отчитываться и платить НДС.
А вот Арбитражный суд Московского округа в своём Постановлении от 14.11.2018 по делу N А40-13318/2018 встал на сторону налогоплательщика.
За все время (около двух лет) инспекция не требовала от налогоплательщика сдачи отчетности по общей системе. Своим поведением налоговая фактически признала, что организация правомерно применяла УСН. Значит, проверяющие утратили право ссылаться на положения НК РФ о том, что нельзя применять спецрежим без уведомления.
Вывод:
Таким образом, если налоговый орган принимал отчётность по упрощённой системе налогообложения, проводил по ней камеральные проверки, то фактически признал право налогоплательщика на применение специального налогового режима.